
在密歇根大学的Jeff Kidd博士、瑞典乌普萨拉大学的Jennifer R. S. Meadows博士和美国国立卫生研究院的Elaine A. Ostrander博士的领导下,科学家们进行了全球合作美国人类基因组研究所(Human Genome Research Institute)正在利用一个例外极其广泛的犬类DNA数据库我知道了。对这一演变进行公正的探讨这些过程产生了我们犬类同伴的不同品种。
最近发表在《基因组生物学》杂志上的一篇论文揭示了Dog10K项目的发现。这项计划涉及对321种不同品种的狗、野狗、土狼和狼的近2000个样本进行基因组测序,并从一只名叫米什卡的德国牧羊犬身上提取了参考样本。
通过检查超过4800万个遗传数据点,研究显示,每个品种的狗都表现出大约300万个单核苷酸多态性差异。
这些单核苷酸多态性,通常缩写为SNPs或俗称为“snips”,是人类和狗之间观察到的遗传多样性的主要原因。
此外,该研究还确定了26000个德国牧羊犬特有的缺失序列,这些序列在对比品种中缺失,而在对比品种中缺失了14000个序列,这些序列在米什卡的DNA中缺失。
他进一步指出,这些不同基因中的大多数都与形态有关,这加强了品种之间的区别主要由狗的外表决定的观点。
与狗相比,狼表现出大约14%的遗传多样性。有趣的是,与村庄或城市地区的人类同居但不作为宠物饲养的野狗比纯种狗表现出更高程度的遗传变异性。
此外,使用密歇根大学高性能计算集群处理的数据集揭示了逆转录的不同寻常的普遍性。逆转录基因是当RNA被逆转成DNA并在不同位置重新插入基因组时形成的新基因。
在这项研究中,共鉴定出926个逆转录基因,其中最著名的例子之一是被称为FGF4的逆转录基因。这种特殊的基因导致了腊肠犬和柯基犬等品种的短腿特征。
基德博士的实验室目前正在努力解开狗体内经常出现逆转录基因和基因插入的原因。
Dog10K联盟的优势之一在于其广泛的规模。这种大规模的合作不仅使密歇根大学的研究人员,而且使整个科学界的研究人员能够研究各种犬类特征的遗传基础,甚至是常见的犬类疾病,包括癌症。
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