普氏立克次体是一种细胞内专性革兰氏阴性球芽孢杆菌,可引起流行性斑疹伤寒。通常,受感染的体虱或其排泄物被摩擦到皮肤擦伤处时传播疾病。普拉兹克氏弧菌感染造成的死亡率最高(在没有抗生素治疗的情况下死亡率> 20%,目前为1-7%),其次是流行性斑疹伤寒,通常在不卫生的条件下表现出来(高达15-30%)。传统上,疫苗设计需要病原体生长和两种测定(体内和体外),这既昂贵又耗时。然而,生物信息学和计算生物学的进步加速了有效疫苗设计的发展,减少了对传统的、耗时的实验室实验的需求。减法基因组学和反向疫苗学已成为构建疫苗模型的重要计算方法。因此,我们对菌株马德里E (Proteome ID: UP000002480)的RefSeq序列进行了减法基因组分析,包括与宿主蛋白质组的不相似性、必要性、亚细胞定位、抗原性、非过敏原性和稳定性等因素。基于这些参数,疫苗设计过程选择特异性蛋白,如外膜蛋白R (o05971 1_ricpr PETR;OmpR)。最终,对OmpR进行反向疫苗学方法,包括分子对接、免疫学模拟以及发现b细胞表位和MHC-I和MHC-II表位。因此,我们选择了V11疫苗,并对其进行三维结构建模、TLR和HLA蛋白的分子对接、计算机模拟和载体设计,提出了基于嵌合或多表位的疫苗。本研究获得的结果通过激发新的免疫原性靶点,为抑制普拉兹氏立克次体的途径提供了新的认识。为了进一步评估新设计的V11疫苗对普氏立克次体感染的功效和保护能力,建议进行额外的评估,如体外或体内免疫测定。
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